Provoz počítačově řízeného prošívacího stroje vyžaduje dodržování přísných postupů, aby byla zajištěna bezpečnost zařízení a kvalita prošívání. Konkrétní provozní kroky by se měly řídit příručkou vyhrazeného zařízení; mezi ně obecně patří zapnutí a provedení auto-testu, nastavení parametrů, vzory načítání, spuštění a vypnutí. Operátoři musí během používání sledovat provozní stav zařízení.
Moderní počítačové quiltovací stroje obvykle obsahují funkci automatického{0}}testování systému, která dokáže rychle diagnostikovat provozní stav různých modulů a pomáhat při lokalizaci závad. Operátoři mohou tuto funkci využít pro předběžné kontroly buď rutinně, nebo když dojde k poruše.